Το Καλαμωτό είναι ένα πεδινό χωριό του Δήμου Λαγκαδά του Νομού Θεσσαλονίκης, 5 χλμ. ανατολικά του Ζαγκλιβερίου, της δημοτικής ενότητας Καλινδοίων. Απέχει μόλις 50 χλμ. από τη Θεσσαλονίκη. Η παλαιοντολογική έκθεση δημιουργήθηκε το 2001 στο κτήριο της πρώην κοινότητας του Καλαμωτού. Η θεσμοθέτησή του ως Μουσείο Φυσικής Ιστορίας έγινε το 2003 από την Περιφέρεια Κεντρικής Μακεδονίας (Φ.Ε.Κ. 524/Β/5-5-2003), ενώ η ίδρυση της Εταιρείας των Φίλων του Μουσείου Καλινδοίων έγινε το 2004.
Το μουσείο περιλαμβάνει απολιθωμένα οστά ζώων που ήλθαν στο φως από τις συστηματικές παλαιοντολογικές ανασκαφές του Αριστοτελείου Πανεπιστημίου Θεσσαλονίκης στην περιοχή. Η έρευνα ξεκίνησε το 1999 μετά από πληροφορίες που έδωσε ο Ν. Κυριαζίδης ότι ο Γ. Γάκης εντόπισε απολιθώματα στην περιοχή του. Ενημερώθηκαν η Εφορεία Αρχαιοτήτων (αρχαιολόγος Δρ. Κ. Σισμανίδης), το Τμήμα Αρχαιολογίας (Καθηγ. Κ. Κωτσάκης) και το Τμήμα Γεωλογίας του Α.Π.Θ.
Οι παλαιοντολογικές έρευνες και ανασκαφές συνεχίζονται με υπεύθυνη την Ευαγγελία Τσουκαλά, Καθηγήτρια Παλαιοντολογίας. Το 2000 πραγματοποιήθηκαν ανασκαφές στην περιοχή σε διάφορες θέσεις και έφεραν στο φως απολιθωμένα οστά ζώων που έζησαν πριν από 1.000.000 χρόνια. Η πρώτη θέση (KLT) εντοπίζεται σε καφέ-κόκκινα ιζήματα, περίπου 2 χλμ. ΝΑ από το Καλαμωτό, στο ρέμα Βασμούρας, δίπλα στα αρχαία Καλίνδοια, όπου καταγράφηκαν μέχρι σήμερα 1075 απολιθωμένα οστά από μαμμούθ, ρινόκερο, ιπποπόταμο, μεγαλόκερο, κόκκινο ελάφι, πλατώνι, βίσονα, αρχαϊκό άλογο, λύκο, μαχαιρόδοντα και γιγαντιαία ύαινα.
